Российские ученые нашли последовательность нуклеотидов, характерную для дефектных микроРНК. Это открытие позволит предсказывать ошибки в поведении микроРНК и создавать на их основе более успешные лекарственные препараты. Результаты исследования опубликованы в журнале RNA Biology.
МикроРНК (miRNA) представляет собой небольшие молекулы, которые регулируют различные процессы в клетке. Каждая микроРНК имеет собственный набор мишеней — это гены, активность которых она способна подавлять. Последние исследования показали, что даже самые небольшие изменения в нуклеотидной последовательности микроРНК (так называемые изоформы микроРНК, isomiR) могут полностью перестраивать эти мишени. Но ученым было неизвестно, почему у одних микроРНК изоформы встречались, а у других — нет.
Ученые факультета биологии и биотехнологии ВШЭ смогли построить алгоритм, который позволяет охарактеризовать различия между имеющими и не имеющими изоформы микроРНК. Исследователям удалось выяснить, что комбинации нуклеотидов АGСU и AGUU наиболее часто встречаются в тех микроРНК, где ошибок не бывает. А по комбинации букв CCAG и некоторым ее вариациям с точностью до 70% можно предсказать возникновение изменений и сбой в прицеле. Проведенное исследование также имеет практическое значение для создания искусственных молекул, похожих на микроРНК, которые могли бы подавить определенные гены. У таких искусственных молекул также могут быть изоформы, выяснили ученые.
«Выделение последовательностей малых РНК в наших экспериментах показало, что у них также бывают изоформы. Это значит, что возможна ситуация, когда мы придумаем молекулу с конкретным списком мишеней, но при практическом использовании появятся непредвиденные формы (изоформы) со своими собственными мишенями, подавление которых не входило в наши планы. Наш алгоритм позволяет предсказать такое событие еще на уровне компьютерного анализа, без необходимости проведения достаточно дорогих экспериментов», — подводит итог младший научный сотрудник Международной лаборатории микрофизиологических систем ВШЭ Степан Нерсисян.
Подписывайтесь на InScience.News в социальных сетях: ВКонтакте, Telegram, Одноклассники.
