Российские ученые исследовали эффективность T-клеточного иммунного ответа против варианта SARS-CoV-2 омикрон. Результаты исследования показали, что у 90% вакцинированных москвичей T-клеточный иммунитет столь же эффективен в борьбе с омикроном, как и с другими штаммами. Статья опубликована на портале bioRxiv.
Омикрон-штамм вируса SARS-CoV-2 вызвал новую волну пандемии во всем мире. Новые мутации позволили вирусу эффективнее распространяться и уклоняться от антител, заражая переболевших и вакцинированных. Однако тяжесть заболевания у вакцинированных на порядок ниже, чем у не встречавшихся с вирусом. Ученые полагают, что это можно объяснить несколькими факторами. Штамм омикрон медленнее заражает клетки человека, также существует гипотеза, связывающая легкое течение болезни с эффективной работой Т-клеточного иммунитета.
Чтобы проверить это предположение, ученые с факультета биологии и биотехнологии ВШЭ и ИБХ РАН исследовали омикрон-штамм на наличие мутаций, позволяющих ему скрываться от Т-клеточного иммунного ответа. Развитие Т-клеточного ответа начинается с узнавания вирусных пептидов молекулами главного комплекса гистосовместимости человека (HLA). Чем больше пептидов они распознали, тем быстрее и эффективнее действует Т-клеточный иммунитет. Мутации вируса могут изменить такие пептиды, чтобы они остались неузнанными молекулами HLA, в этом случае Т-клеточный ответ будет менее эффективен.
Биоинформатический алгоритм T-CoV показал, что омикрону не удалось скрыться ни от одного варианта молекул HLA. Однако некоторые варианты HLA стали хуже узнавать S-белок омикрона. Важной находкой оказался вариант молекулы HLA-DRB1*03:01, от которого скрылся наиболее значимый пептид вируса. Ученые доказали, что между пептидами омикрона и экспрессированной в пробирке молекулой HLA-DRB1*03:01 не происходит связывания. При этом исходный пептид из уханьского базового штамма и дельты эффективно распознается этой молекулой. Ученые подчеркивают, что вариант HLA-DRB1*03:01 присутствует у большого процента населения планеты, например у 8,9% европейцев, 10% жителей Москвы.
«Популяционное разнообразие вариантов молекул HLA, а также специфичность их работы не позволяют вирусу ускользать от T-клеточного иммунного ответа. Тем не менее от одной из молекул HLA вирусу удалось скрыть свой S-белок. Важно, что большинство вакцин против COVID-19 (Спутник V, вакцины Pfizer и Moderna, AstraZeneca и некоторые другие) несут в себе именно этот вирусный белок. Это означает, что люди с вариантом HLA-DRB1*03:01 (в Москве таких около 10%), вакцинированные S-белком, могут тяжелее переносить болезнь, вызванную штаммом омикрон», — говорит соавтор исследования Александр Тоневицкий.
Подписывайтесь на InScience.News в социальных сетях: ВКонтакте, Telegram, Одноклассники.
