Американские ученые из Калифорнийского университета в Санта-Крузе показали, что мутации, вызывающие рак, влияют на некодирующую РНК, которая осуществляет регуляторные функции. Результаты исследования закладывают основу для нового метода ранней диагностики рака. Работа опубликована в журнале Cell Reports.
В геноме человека известны онкогены, продукты которых вызывают развитие и рост злокачественных опухолей. Один из таких генов — KRAS. В этом гене чаще всего встречаются мутации при раке, особенно при опухолях поджелудочной железы, легких или кишечника. Считается, что KRAS действует как «молекулярный переключатель» и мутация в этом гене вызывает развитие рака. Исследование этого гена необходимо для понимания этиологии рака и ранней диагностики опухолей.
Ученые исследовали влияние мутации в гене KRAS при раке легких на некодирующую РНК (нкРНК). Этот тип РНК охватывает около 75% всех молекул РНК в клетках человека. Эксперименты проводились на клеточных культурах. Ученые провоцировали нужную мутацию в гене KRAS, чтобы индуцировать в клетках процесс образования опухоли. Затем они провели эпигеномный анализ, чтобы определить, какие гены «включаются» и «выключаются», секвенировали РНК и сделали вычислительный анализ, чтобы выяснить, какие молекулы РНК экспрессируются в опухолевых и контрольных клетках. Оказалось, что из-за мутаций в гене KRAS происходит сайленсинг (подавление экспрессии) класса генов KRAS-ZFP, кодирующих определенные белки. Из-за этого активируются некоторые типы нкРНК. Многие из них являются производными транспозонов — повторяющимися элементами, которые находятся в геноме человека и способны передвигаться по нему. Оказалось, что эти нкРНК выбрасывались за пределы клеток в составе везикул. Их присутствие в крови можно воспринимать как маркер мутаций в гене KRAS, что важно для ранней диагностики рака.
В будущем ученые собираются подтвердить свои результаты, проанализировав образцы крови от пациентов с раком легких. Если присутствие новых РНК-маркеров в крови подтвердится, то исследователи смогут разработать тест для их выявления.
Подписывайтесь на InScience.News в социальных сетях: ВКонтакте, Telegram, Одноклассники.
