Loading...

По ДНК из воздуха можно определить обитателей зоопарка
Elizabeth Clare

Две научные группы из Лондонского университета королевы Марии (Великобритания) и Копенгагенского университета (Дания) независимо друг от друга доказали, что по ДНК, содержащейся в образцах воздуха из зоопарков, можно определить видовой состав населяющих их животных. Статьи о проделанной работе опубликованы в журнале Current Biology.

Изучение биологического разнообразия важно для экологов и других специалистов. За наземными животными можно наблюдать по-разному: напрямую, с помощью камер или людей, или косвенно, отыскивая следы животных или их фекалии. Недостатком всех этих методов является то, что они требуют тяжелой полевой работы. Кроме того, при установке камер нужно знать, где бывает животное. А затем биологам приходится просматривать тысячи фотоснимков в поисках нужных.

Для исследования же морского биологического разнообразия ученые часто используют так называемую экологическую ДНК (эДНК). При ее секвенировании можно определить видовой состав морских обитателей. И теперь британские и датские ученые решили применить этот метод, чтобы проанализировать видовое разнообразие на суше.

В исследовании ученые собирали образцы воздуха из разных участков местных зоопарков: как из закрытых местностей, так и из открытых. Для этого использовался вентилятор с прикрепленным к нему фильтром. В вентилятор засасывался воздух, содержащий генетический материал из большого числа источников: дыхание, слюна, шерсть, фекалии. После фильтрации воздуха ученые забирали образцы ДНК с фильтров. Далее они проводили ПЦР, чтобы получить множество копий животной ДНК, и секвенировали эДНК. Полученные последовательности исследователи сравнивали с базой данных референсной ДНК, чтобы идентифицировать виды.

Британские ученые обнаружили 25 видов млекопитающих и птиц. Среди них оказался даже обыкновенный еж — этот вид в Великобритании считается вымирающим. Датские ученые обнаружили 49 видов позвоночных, в том числе млекопитающих, птиц, рептилий, амфибий и рыб. К ним относились звери из зоопарка (окапи, броненосец, гуппи), местные звери (белки) и животные-вредители (крысы и мыши). Исследователям даже удалось идентифицировать рыб, которых используют для кормления зверей в зоопарке. Обе команды ученых тщательным образом удостоверились в том, что полученные ими образцы не были загрязнены.

«Изначально мы планировали отправиться на ферму. Но если бы мы идентифицировали ДНК коровы, то возник бы вопрос: это корова с фермы, корова, которая обитает в сотне километров от нее или просто говядина из чьего-то обеда? Однако если использовать в качестве модели зоопарк, то когда я обнаружу ДНК тигра, это без сомнения будет тигр из зоопарка. Такая модель позволила нам проверить уровень обнаружения видов», — объяснила выбор модели Элизабет Клэр из Лондонского университета королевы Марии.


Подписывайтесь на InScience.News в социальных сетях: ВКонтакте, Telegram, Facebook и Twitter.