С помощью искусственного интеллекта британские ученые разработали атлас белков. Он описывает, как молекулы ведут себя внутри клеток человека и собираются в единую структуру в белковом конденсате клетки. В ходе работы над атласом ИИ обнаружил ранее не наблюдавшиеся там белки. С помощью нового атласа ученые смогут отслеживать каждый белок в клетке по отдельности и найти причины заболеваний, связанных с неправильным поведением белков, — например, деменции. Исследование опубликовано в журнале Nature Communications.
Клеточные белки собираются вместе в белковых конденсатах, находящихся внутри клетки. Эти конденсаты — часть основного механизма, обеспечивающего работу клеток, а также место, проблемы с которым приводят к опасным заболеваниям. До сих пор у ученых не было полной карты того, какие белки объединяются в белковых конденсатах.
Британские исследователи решили это исправить. Они проанализировали базы данных StringDB и BioGRID и с помощью искусственного интеллекта разработали единый атлас белков. Он описывает, как молекулы ведут себя внутри клеток человека. На основе данных о работе клеток ИИ обнаружил в модельной клетке ранее не наблюдавшиеся белки.
«В ходе исследования мы обнаружили в конденсатах белки, которые никогда раньше там не наблюдались. Эти белки участвуют в важных функциях организма, таких как распределение жира, выработка актина внутри клеток и создание новых белков. Они не были замечены в предыдущем исследовании, которое мы использовали в качестве тренировочного набора», — рассказала Кади Лиис Саар, первый автор исследования из центра Centre for Misfolding Diseases.
С помощью нового атласа ученые смогут отслеживать каждый белок в клетке по отдельности, прогнозировать то, где он может быть обнаружен и с какими другими белками он может взаимодействовать. Это позволит найти причины заболеваний, связанных с неправильным поведением белков, — например, деменции и некоторых видов рака.
Подписывайтесь на InScience.News в социальных сетях: ВКонтакте, Telegram, Одноклассники.
