Немецкие ученые разработали алгоритм искусственного интеллекта, получивший название scArches. Он существенно упростит работу с данными по транскриптомике одиночных клеток и позволит сравнивать, аннотировать и интерпретировать данные, сохраняя конфиденциальность. Статья опубликована в журнале Nature Biotechnology.
«Атлас человеческих клеток» — крупнейший справочник, содержащий информацию об экспрессии генов в миллионах отдельных клеток тканей и органов человеческого организма на разных стадиях развития. Такая база данных помогает изучать старение и влияние среды на организм, а также улучшать методы диагностики и лечения заболеваний. Однако базы данных могут содержать ошибки. Кроме того, вычислительных ресурсы не всегда доступны, а совместное использование необработанных данных часто ограничено законом.
Немецкие ученые разработали новый алгоритм искусственного интеллекта«scArches», который позволит избежать обмена необработанными данными между клиниками и исследовательскими центрами. Алгоритм использует трансферное обучение для сравнения новых наборов данных с существующими ссылками, сохраняя при этом конфиденциальность и анонимность. Алгоритм также упрощает аннотирование и интерпретацию новых наборов данных.
Исследователи применили scArches для изучения клеток бронхов, зараженных COVID-19. Они сравнили транскриптомику одиночных клеток пациентов с COVID-19 и здоровых людей. Алгоритм смог безошибочно отделить больные клетки от здоровых как для легких, так и для тяжелых случаев COVID-19. Различия между пациентами никак не повлияли на качество процесса.
Подписывайтесь на InScience.News в социальных сетях: ВКонтакте, Telegram
Подписывайтесь на InScience.News в социальных сетях: ВКонтакте, Telegram, Одноклассники.
