Международная группа ученых показала, как наследственные генетические варианты влияют на развитие и поведение рака. Команда проанализировала данные 1064 пациентов с 10 типами рака, включая рак молочной железы, легких и меланому, с помощью методов пептидомики. Это позволило сопоставить 337 469 наследственных генетических вариантов с изменениями в структуре и функциях белков опухолей. Они выявили, что уникальные генетические особенности конкретного человека влияют на характеристики его опухоли. Например, исследование выявило изменения в белках SIRPA и GFAP, которые могут быть связаны с иммунным ответом на глиобластому. Эти результаты могут изменить подход к лечению рака, добавив учет наследственной ДНК пациента к анализу мутаций опухоли. Работа опубликована в журнале Cell.
Белки в клетках выполняют множество разных функций. Они поддерживают форму клетки, помогают им работать и защищают от болезней. В раковых опухолях белки могут вести себя иначе, чем в здоровых клетках. Например, некоторые белки помогают раковым клеткам расти и распространяться, а другие могут «обманывать» иммунную систему, чтобы она не замечала опухоль и не боролась с ней. У разных людей белки могут отличаться из-за наследственных генетических особенностей, которые влияют на то, как именно они работают в клетках.
Исследователи изучили, как наследственные генетические вариации влияют на развитие и поведение рака. Они проанализировали данные 1064 пациентов с 10 различными типами рака. Основной метод исследования — прецизионная пептидомика, которая позволяет оценить влияние наследственных мутаций на структуру, стабильность и функции белков в опухолевых клетках.
Ученые проанализировали 337 469 генов, чтобы выяснить, как эти изменения влияют на экспрессию генов и активность белков. Они показали, что наследственные мутации могут изменять структуру белков, их количество и посттрансляционные модификации. Например, команда обнаружила мутации в генах ERBB2 и MAP2K2, которые влияют на фосфорилирование — ключевой процесс в регуляции клеточной активности. Также исследование выявило изменения в белках SIRPA и GFAP, которые могут быть связаны с иммунным ответом и диагностикой глиобластомы.
Группа использовала данные масс-спектрометрии, что позволило ученым составить карту взаимосвязи между генетическими вариантами и белками. В результате исследование показало, что наследственные генетические различия могут определять агрессивность опухоли, ее взаимодействие с иммунной системой и ответ на лечение.
Однако авторы подчеркивают, что свои выводы они сделали в основном на данных пациентов европейского происхождения. Для подтверждения этих результатов и их применения к представителям других этнических групп необходимы дальнейшие исследования.
«Наша работа показывает, что унаследованные изменения ДНК могут влиять на то, как белки — ключевые движущие силы поведения рака — вырабатываются и изменяются в опухолях. Эти варианты помогают объяснить некоторые из многих различий, которые врачи видят в том, как рак появляется, прогрессирует и реагирует на терапию от одного пациента к другому», — говорит Зейнеп Х. Гюмюш из Медицинской школы Икана комплекса Маунт-Синай.
Автор: Оксана Гриценко.
Подписывайтесь на InScience.News в социальных сетях: ВКонтакте, Telegram, Одноклассники.
