Ученые разработали новый способ отслеживания распространения и эволюции патогенов, а также их реакции на вакцины и антибиотики. Подход подразумевает исследование генома патогена, а также анализ перемещений людей с помощью анонимных данных мобильных телефонов. Исследование с помощью нового метода показало, что снижение антибиотикорезистентности у пневмококков, связанное с появлением вакцины в 2009 году, может быть временным. Работа опубликована в журнале Nature.
Многие патогены, в том числе ВИЧ, коронавирус, туберкулез, существуют в разных вариантах — штаммах. Пневмококк — бактерия, которая вызывает пневмонию, менингит и сепсис. Только от пневмонии ежегодно умирает около 740 тысяч детей в возрасте до пяти лет. Пневмококк имеет более 100 типов и 900 штаммов. Такое разнообразие усложняет и лечение, и разработку вакцин, ведь если препарат нацелен на основные штаммы, то от других человек не будет защищен.
Международная группа исследователей решила узнать, как бактерии, вызывающие пневмонию и менингит, распространяются по регионам и эволюционируют. Специалисты объединили данные о геноме почти 7 тысяч образцов Streptococcus pneumoniae (пневмококк), которые собрали в ЮАР с 2000 по 2014 год, и анонимную информацию о перемещении людей.
Команда разработала вычислительные модели, которые показали, что штаммы пневмококка распространяются медленно. Им нужно около 50 лет, чтобы распространиться среди населения ЮАР.
Также специалисты выяснили, что вакцина от пневмококка 2009 года сократила количество заболеваний от штаммов, против которых направлен препарат. Однако прививка также дала другим вариантам конкурентное преимущество: они становятся устойчивыми к антибиотикам. Это говорит о том, что снижение антибиотикорезистентности у патогена — временный эффект.
Обычно пневмококковые бактерии распространяются медленно, но из-за передвижений людей и использования вакцины только от определенных штаммов динамика ускоряется.
Ученые отмечают, что необходимо контролировать эволюцию и перемещения вируса, а также то, какой именно штамм является основным возбудителем в тот или иной момент. Для этого важно создавать новые препараты, которые позволят вырабатывать иммунитет против менее распространенных, но потенциально опасных штаммов пневмококка.
Подписывайтесь на InScience.News в социальных сетях: ВКонтакте, Telegram, Одноклассники.
