Ученые из Мичиганского университета медицины сравнили активность генов при различных видах почечной карциномы. Выявленные отличия могут стать биомаркерами, по которым врачи будут выбирать наиболее эффективный метод лечения. Статья опубликована в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences.
Различные типы опухолей почек по-разному реагируют на иммунотерапию и другие виды лечения. Поэтому шансы на выздоровление зависят от выбора метода и точности используемых биомаркеров. Чтобы упростить типирование опухолей и найти новые особенности клеток, влияющие на исход терапии, авторы исследования применили метод одиночного РНК-секвенирования.
В последовательности ДНК содержится инструкция по сборке белковых молекул. Ее можно сравнить с рукописью, которая хранится у автора. Чтобы не повредить оригинал, используются его копии, то есть молекулы РНК. В зависимости от того, насколько востребован тот или иной фрагмент книги, его копий будет больше или меньше. На этом основан метод РНК-секвенирования. Ученые узнают, как много копий РНК данного вида присутствует в образце, и сравнивают их последовательности с оригинальным фрагментом в ДНК. Чем более активен тот или иной участок ДНК, тем больше его копий будет найдено.
Исследователи нашли клетки с похожими профилями активности генов среди доброкачественных и злокачественных опухолей. Это позволило найти те, с которых, вероятно, начался процесс озлокачествления. Кроме того, они выявили отличия в активности генов между разными частями клетки при распространении рака на соседние ткани. Затем они нашли корреляции между этими отличиями, выживаемостью пациентов и ответом опухоли на терапию. Оказалось, что важную роль в распространении опухоли играет клеточный эпителий, и именно от его особенностей во многом зависит исход лечения.
«РНК-секвенирование одиночных клеток стало для нас ключом к пониманию индивидуальных свойств опухолей. Наша работа поможет не только точнее предсказывать шансы на выздоровление пациентов, но и эффективнее проводить лечение. Кроме того, мы внесли некоторую ясность в механизмы развития почечных опухолей. Понимание того, с каких клеток начинается процесс озлокачествления, также поможет эффективнее бороться с онкологическими заболеваниями», — рассказывает Арул Чинайян, доктор медицинских наук, глава Мичиганского центра трансляционной патологии.
Подписывайтесь на InScience.News в социальных сетях: ВКонтакте, Telegram, Одноклассники.
